監測計畫
臺灣地區整體水質監測工作始於民國65年，臺灣省水污染防治所規劃辦理之河川水質監測，其次在進行地下水水質監測，但自88年精省後，原省環保處三區中心執行之河川水質監測業務調整，於90年9月本處奉示接辦河川、海域、水庫及地下水等水體例行性環境水質監測工作，並以委託計畫方式，自91年起每3年以北、中、南三區(以下簡稱三區)委由合格代檢測業辦理「環境水質北、中、南區監測計畫」，經費由水保處於公共建設編列並陳報行政院核定。 本處自91年起依據行政院核定之「臺灣地區河川流域及海洋經營管理方案」（91至93年）暨「河川及海洋水質維護改善計畫(第1~2期)」（94至100年），統籌辦理全國「環境水質監測」工作，每年度執行臺、澎、金、馬等水體例行性水質監測約6,000站次，共產製約10萬筆水質監測資料，經品保及品管審查後，每月定期上載於本署「全國環境水質監測資訊網」，編製年報，提供各界查詢使用，建立長期水質變化趨勢資料並作為污染防治決策參考，自94年迄今，瀏覽人數超過11萬7千人次。並且於每年夏季執行海灘水質監測，並發布新聞稿提醒民眾注意。97年起與地方環保局、自來水公司、水利署、農委會等單位進行監測資料交換作業。
河川
自民國65年起，前臺灣省政府水污染防治所為建立本省河川水質之長期資料，即持續辦理河川水質監測工作。91年起主要水質監測作業由本署監資處執行，目前共監測318個測站。每月監測項目如下表。
91~93年度監測項目 94~95年度監測項目 96年度監測項目 97~99年度監測項目 100-101年度監測項目 監測頻率
水溫、pH、導電度、溶氧、生化需氧量、懸浮固體、氨氮、化學需氧量、大腸桿菌群 水溫、pH、導電度、溶氧、生化需氧量、懸浮固體、氨氮、化學需氧量、大腸桿菌群、總有機碳 水溫、pH、導電度、溶氧、生化需氧量、懸浮固體、氨氮、化學需氧量、大腸桿菌群 水溫、pH、導電度、溶氧、生化需氧量、懸浮固體、氨氮、化學需氧量、大腸桿菌群 水溫、pH、導電度、溶氧、生化需氧量、懸浮固體、氨氮、化學需氧量、大腸桿菌群 每月一次
硝酸鹽氮、亞硝酸鹽氮、總凱氏氮、總磷、鎘、鉛、六價鉻、砷、汞、硒、銅、鋅、錳、銀 硝酸鹽氮、亞硝酸鹽氮、總凱氏氮、總磷、鎘、鉛、六價鉻、砷、汞、硒、銅、鋅、錳、銀 硝酸鹽氮、亞硝酸鹽氮、總磷、鎘、鉛、六價鉻、砷、汞、硒、銅、鋅、錳、銀、總有機碳 硝酸鹽氮、亞硝酸鹽氮、總磷、鎘、鉛、六價鉻、砷、汞、硒、銅、鋅、錳、銀、總有機碳 硝酸鹽氮、亞硝酸鹽氮、總磷、鎘、鉛、六價鉻、砷、汞、硒、銅、鋅、錳、銀、總有機碳 每季一次(3、6、9、12)

水庫
本署自民國82年起每年針對臺灣地區20座主要水庫進行例行性水質監測，監測結果並以總磷、葉綠素-a及透明度三項測值計算卡爾森指數(Carlson trophic state index, CTSI)，用以表示水庫水質優養化程度。自91年度起，水庫水質監測作業擴及包括本島及離島（含澎湖縣、金門縣及連江縣），目前共計60座水庫，116個採樣點。水庫水質之監測頻率為每季一次。監測項目如下表。
91~93年度監測項目 94~95年度監測項目 96年度監測項目 97~99年度監測項目 100-101年度監測項目 監測頻率
水溫、透明度、pH、導電度、溶氧、濁度、懸浮固體、硬度、總鹼度、化學需氧量、氨氮、硝酸鹽氮、亞硝酸鹽氮、有機氮、總磷、葉綠素a、磷酸鹽 水溫、透明度、pH、導電度、溶氧、濁度、懸浮固體、硬度、總鹼度、化學需氧量、氨氮、硝酸鹽氮、亞硝酸鹽氮、有機氮、總磷、葉綠素a、磷酸鹽、總有機碳 水溫、透明度、pH、導電度、溶氧、濁度、懸浮固體、硬度、總鹼度、化學需氧量、氨氮、硝酸鹽氮、亞硝酸鹽氮、總磷、葉綠素a、磷酸鹽、總有機碳 水溫、透明度、pH、導電度、溶氧、濁度、懸浮固體、硬度、總鹼度、化學需氧量、氨氮、硝酸鹽氮、亞硝酸鹽氮、總磷、葉綠素a、磷酸鹽、總有機碳 水溫、透明度、pH、導電度、溶氧、濁度、懸浮固體、硬度、總鹼度、化學需氧量、氨氮、硝酸鹽氮、亞硝酸鹽氮、總磷、葉綠素a、磷酸鹽、總有機碳 每季一次(2、5、8、11)

地下水
本署於民國91年開始執行臺灣地區區域性地下水監測井水質監測，目前共有431口地下水監測井，監測項目如下表。
91~93年度監測項目 94~95年度監測項目 96年度監測項目 97~99年度監測項目 100-101年度監測項目 監測頻率
水溫、pH、導電度、總硬度、總溶解固體、氯鹽、氨氮、硝酸鹽氮、硫酸鹽、總有機碳、鎘、鉛、鉻、砷、銅、鋅、錳、鐵(91年第四季開始監測) 水溫、pH、導電度、總硬度、總溶解固體、氯鹽、氨氮、硝酸鹽氮、硫酸鹽、總有機碳、鎘、鉛、鉻、砷、銅、鋅、錳、鐵、鉀、鈣、鎂、鹼度 水溫、pH、導電度、總硬度、總溶解固體、氯鹽、氨氮、硝酸鹽氮、硫酸鹽、總有機碳、鎘、鉛、鉻、砷、銅、鋅、錳、鐵 水溫、pH、導電度、總硬度、總溶解固體、氯鹽、氨氮、硝酸鹽氮、硫酸鹽、總有機碳、鎘、鉛、鉻、砷、銅、鋅、錳、鐵 水溫、pH、導電度、總硬度、總溶解固體、氯鹽、氨氮、硝酸鹽氮、硫酸鹽、總有機碳、鎘、鉛、鉻、砷、銅、鋅、錳、鐵、汞、鎳 每季一次(2、5、8、11)
--- --- 鈉、鉀、鈣、鎂、鹼度 鈉、鉀、鈣、鎂、鹼度 鈉、鉀、鈣、鎂、鹼度 每半年一次

海域
現行臺灣地區的海域水質監測乃自91年度開始執行，將沿海規劃成19個沿海區域，總計有104個監測站。現行海域水質監測頻率為每季一次，監測項目如下表。
91~93年度監測項目 94~95年度監測項目 96年度監測項目 97~99年度監測項目 100-101年度監測項目 監測頻率
水溫、鹽度、溶氧、pH、懸浮固體、葉綠素a、硝酸鹽氮、亞硝酸鹽氮、磷酸鹽、矽酸鹽、鎘、鉻、汞、銅、鋅、鉛 水溫、鹽度、溶氧、pH、懸浮固體、葉綠素a、氨氮、硝酸鹽氮、亞硝酸鹽氮、磷酸鹽、矽酸鹽、鎘、鉻、汞、銅、鋅、鉛 水溫、鹽度、溶氧、pH、懸浮固體、葉綠素a、氨氮、硝酸鹽氮、亞硝酸鹽氮、磷酸鹽、矽酸鹽、鎘、鉻、汞、銅、鋅、鉛 水溫、鹽度、溶氧、pH、懸浮固體、葉綠素a、氨氮、硝酸鹽氮、亞硝酸鹽氮、磷酸鹽、矽酸鹽、鎘、鉻、汞、銅、鋅、鉛 水溫、鹽度、溶氧、pH、懸浮固體、葉綠素a、氨氮、硝酸鹽氮、亞硝酸鹽氮、磷酸鹽、矽酸鹽、鎘、鉻、汞、銅、鋅、鉛 每季一次(2、5、8、11)

海灘水質
為讓民眾瞭解海灘水質，做為親水活動參考，本署自民國88年起，於夏日泳季6~9月期間進行監測，91至97年監測範圍為臺灣本島10處海灘，98年擴及澎湖、金門、馬祖等共13處海灘，99年邀集 邀集交通部觀光局、相關風景區管理處、各縣(市)政府環保局共同研商結果，選擇戲水遊客較多的海灘，並刪除未營運管理之大安海水浴場及崎頂海水浴場，共執行23處海灘。100年參考歷年監測點予以調整，共執行20處海灘監測，監測期間為3個月(即6至8月)，監測頻率為7、8月每週1次，6月底預監測1次，全年計約10次。採樣時於該海灘水域安全索範圍內，左、中、右各一處，水深約1公尺處採集水樣，每次採樣同時拍照紀錄海灘環境及水色等現場資訊，資料發布分級方式則分為「優良」、「普通」、「不宜親水活動」等3級。
91~93年度監測項目 94~95年度監測項目 96年度監測項目 97~99年度監測項目 100-101年度監測項目 監測頻率
水溫、鹽度、溶氧、pH、濁度、硝酸鹽氮、亞硝酸鹽氮、磷酸鹽、矽酸鹽、大腸桿菌群、腸球菌 水溫、鹽度、溶氧、pH、濁度、氨氮、硝酸鹽氮、亞硝酸鹽氮、磷酸鹽、矽酸鹽、大腸桿菌群、腸球菌 水溫、鹽度、溶氧、pH、濁度、氨氮、硝酸鹽氮、亞硝酸鹽氮、磷酸鹽、矽酸鹽、大腸桿菌群、腸球菌 水溫、鹽度、溶氧、pH、濁度、氨氮、硝酸鹽氮、亞硝酸鹽氮、磷酸鹽、矽酸鹽、大腸桿菌群、腸球菌 水溫、鹽度、溶氧、pH、濁度、氨氮、硝酸鹽氮、亞硝酸鹽氮、磷酸鹽、矽酸鹽、大腸桿菌群、腸球菌 6月至9月每雙週一次，7與8月增加頻率為每週1次
更新日期:2011年10月03日